Neste arquivo, /etc/entropy/client.conf, (que eu uso em Sabayon) mostro como você deve editar as configurações, para poder usar os dois instaladores de pacotes (Entropy e Portage, do Gentoo), ao mesmo tempo.

Ainda contém configurações para acelerar o Entropy (sistema Delta e download múltiplo de arquivos) e para proteger arquivos ou diretórios importantes para que não sejam modificados nas atualizações.