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7 de Dezembro de 2009, 0:00 , por Software Livre Brasil - | Ninguém está seguindo este artigo ainda.

Free and Open Source Bioinformatics Software for Linux

23 de Julho de 2010, 0:00, por Software Livre Brasil - 0sem comentários ainda

Segue algumas iniciativas de software open source para BioInfo: BioEclipse, BioRails e UGENE.

Maiores detalhes no artigo originalmente em inglês: Free and Open Source Bioinformatics Software for Linux - http://www.junauza.com/2009/11/free-and-open-source-bioinformatics.html

Bioinformatics, as defined by the National Center for Biotechnology Information (BCBI), is the field of science in which biology, computer science, and information technology merge into a single discipline.

Bioinformatics is being used largely in the field of human genome research by the Human Genome Project, which has been determining the sequence of the entire human genome (about 3 billion base pairs) and is essential in using genomic information to understand diseases. It is also used largely for the identification of new molecular targets for drug discovery.

To aid scientists as well as students in their analysis and study, I have a here a list of some of the most capable free and open source Bioinformatics software for Linux.

 



Bioinformática - Clustalw-MPI: Análise Filogenética utilizando computação paralela e distribuída

23 de Julho de 2010, 0:00, por Software Livre Brasil - 0sem comentários ainda

Por José Cleydson Ferreira da Silva

O software Clustalw-MPI é a ferramenta mais popular na implementação de múltiplo alinhamento de sequência de DNA. Sua principal diferença entre o software ClustalX dá-se a que ele possui uma melhor performance computacional devido realização do processamento em paralelo ou distribuído.


Bioinformática - Análise Filogenética com Clustalx

23 de Julho de 2010, 0:00, por Software Livre Brasil - 0sem comentários ainda

Por José Cleydson Ferreira da Silva

O Clustalx é um software para o alinhamento de sequências nucleotídicas, peptídicas e analises filogênicas. O Clustalx é software semi-livre segundo a sua forma de licenciamento. Embora possua características de software livre como permissão de execução de programa, não há permissão de uso para fins comerciais.


Bioinformática - Instalação do Mr Bayes em ambiente paralelo

23 de Julho de 2010, 0:00, por Software Livre Brasil - 0sem comentários ainda

Por José Cleydson Ferreira da Silva

Um dos melhores softwares da área da bioinformática é o Mr Bayes. Seu maior dilema é o processamento em ambiente paralelo, portanto este documento relata a instalação do MrBayes em sua versão para processamento paralelo e adaptação para arquitetura 64 bits de versão do MrBayes para processamento paralelo.